Hlavním hráčem v katalytickém mechanismu v serinových proteázách je katalytická triáda katalytická triáda Katalytická triáda je soubor tří koordinovaných aminokyselin, které lze nalézt v aktivní místo některých enzymů. Katalytické triády se nejčastěji vyskytují u enzymů hydrolázy a transferázy (např. proteázy, amidázy, esterázy, acylázy, lipázy a β-laktamázy). https://en.wikipedia.org › wiki › Catalytic_triad
Katalytická triáda – Wikipedie
. … Serin má -OH skupinu, která je schopna působit jako nukleofil a napadat karbonylový uhlík štěpné peptidové vazby substrátu.
Jak fungují inhibitory serinových proteáz?
Inhibitory serinových proteáz neboli serpiny zahrnují rodinu proteinů, které antagonizují aktivitu serinových proteáz. … V tomto mechanismu serpin představuje peptidovou sekvenci napodobující substrát – reaktivní centrální smyčku – své cílové serinové proteáze.
Jakou roli v mechanismu reakce serinové proteázy hraje systém přenosu náboje?
Role Asp102 v katalytickém reléovém systému serinových proteáz je studována teoreticky výpočtem profilů volné energie jediné reakce přenosu protonů mutantou Asn102 trypsinem a koordinovaná reakce dvojitého přenosu protonů (tzv. mechanismus nábojového relé) divokého typu trypsinu.
Který z následujících je příkladem serinové proteázy?
Chymotrypsin: >Použito jako příklad serinové proteázy, protože její struktura a mechanismus jsou dobře známy.
Jaké jsou důvody pro tzv. serinové proteázy?
Nazývají se serinové proteázy ze dvou důvodů:
- Hydrolyzují proteiny.
- Na aktivním místě mají esenciální Ser zbytek, který je kritický pro katalýzu. Ve skutečnosti je tento Ser mnohem reaktivnější než ostatní seriny v proteinu.
