V molekulární biologii je STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) biologická databáze a webový zdroj známých a předpokládaných interakcí protein-protein. … Nejnovější verze 11b obsahuje informace o asi 24,5 milionu proteinů z více než 5000 organismů.
Jaký je účel databáze STRING?
Databáze STRING si klade za cíl shromažďovat a integrovat tyto informace konsolidací známých a předpokládaných proteinů–dat o asociaci proteinů pro velké množství organismů.
Co je skóre STRING?
V STRING je každá interakce protein-protein označena jedním nebo více „skóremi“. Důležité je, že tato skóre neindikují sílu nebo specifičnost interakce. Místo toho jsou to ukazatele důvěry, tj. s jakou pravděpodobností STRING považuje interakci za pravdivou, vzhledem k dostupným důkazům.
Proč se proteiny vzájemně ovlivňují?
Interakce protein–protein (PPI) jsou fyzické kontakty s vysokou specifitou vytvořené mezi dvěma nebo více molekulami proteinů jako výsledek biochemických událostí řízených interakcemi, které zahrnují elektrostatické síly, vodík lepení a hydrofobní efekt.
Co je funkční přidružení?
definice. Binární vztah mezi biologickými entitami když jedna z nich moduluje druhou z hlediska funkce, exprese, degradace nebo stability druhé a vztahumezi partnery nelze určit jako přímé, takže mezikroky jsou implicitně přítomny.
