Arabinóza je pětiuhlíkový cukr, který se hojně vyskytuje v přírodě a může sloužit jako jediný zdroj uhlíku v mnoha bakteriích. Proteinové produkty ze tří genů (araB, araA a araD) jsou potřebné pro degradaci arabinózy u členů čeledi Enterobacteriaceae, jako jsou E. coli a S.
Co dělá arabinóza s bakteriemi?
Když je tedy přítomna arabinóza, která aktivuje arabinózový operon, vzniká GFP a bakterie mohou fluoreskovat. Bez arabinózy není gen GFP exprimován a neexistuje žádná fluorescence. Takže změnou složení živin může výzkumník řídit, kdy (a zda) se u transformovaných bakterií objeví florescence.
Jaká je role arabinózy v bakteriální transformaci?
Arabinóza působí jako alosterický regulátor AraC, mění, na která místa DNA se váže a jak tvoří dimer. Pamatujte, že arabinóza je cukr, který je katabolizován proteiny operonu AraBAD. Když je arabinóza přidána do prostředí, ve kterém E. coli žije, pevně se naváže na AraC.
Proč se používá arabinóza?
Použití v biologii
V syntetické biologii se arabinóza často používá jako jednosměrný nebo reverzibilní přepínač pro expresi proteinů pod Pbadpromotor v E. coli. Toto zapnutí může být negováno přítomností glukózy nebo zvráceno přidáním glukózy do kultivačního média, což je forma katabolitové represe.
Jakovlivňuje arabinóza genovou regulaci a expresi v bakteriích?
Pokud je přítomna arabinóza, araC uvolňuje konfiguraci DNA, takže může dojít k transkripci, ale když tento sacharid chybí, stejný protein omezuje DNA, aby se snížila její schopnost vázat se s RNA polymerázou.
