Agarózové gely se používají s DNA kvůli větší velikosti biomolekul (fragmenty DNA mají často tisíce kDa). U proteinových gelů poskytuje polyakrylamid dobré rozlišení, protože mnohem menší velikost (typická je 50 kDa) je vhodnější pro těsnější mezimolekulární mezery gelu.
Jaký je rozdíl mezi elektroforézou na agarózovém gelu a elektroforézou na polyakrylamidovém gelu?
Hlavní rozdíl mezi agarózou a polyakrylamidem je ten, že agaróza se používá v elektroforéze na agarózovém gelu (AGE) hlavně pro separaci DNA, zatímco polyakrylamid se používá v polyakrylamidovém gelu elektroforéza (PAGE) hlavně pro separaci proteinů.
Proč jsou polyakrylamidové gely lepší než agarózový gel?
Polyakrylamidové gely mají oproti agarózovým gelům následující tři hlavní výhody: (1) Jejich rozlišovací schopnost je tak velká, že dokážou oddělit molekuly DNA, jejichž délky se liší jen o 0,1 % (tj. 1 bp na 1000 bp). (2) Dokážou pojmout mnohem větší množství DNA než agarózové gely.
Proč se při charakterizaci proteinů místo agarózy používá polyakrylamid?
Polyakrylamid a agaróza jsou dvě podpůrné matrice běžně používané v elektroforéze. … Agaróza má velkou velikost pórů a je vhodná pro separaci nukleových kyselin a velkých proteinových komplexů. Polyakrylamid má menší velikost pórů a je ideální prooddělující většinu proteinů a menších nukleových kyselin.
Proč se používá polyakrylamidový gel?
Polyakrylamidová gelová elektroforéza (PAGE) se rutinně používá pro analýzu proteinů a lze ji také použít k separaci fragmentů nukleových kyselin menších než 100 bp. Nukleové kyseliny se obvykle analyzují pomocí kontinuálního pufrového systému, kde je konstantní složení pufru, pH a velikost pórů v celém gelu.
