BLAST lze použít k několika účelům. Patří mezi ně identifikace druhů, lokalizace domén, stanovení fylogeneze, mapování DNA a srovnání. S použitím BLAST můžete případně správně identifikovat druh nebo najít homologní druhy.
K čemu se BLAST používá?
BLAST je počítačový algoritmus, který je k dispozici pro použití online na webových stránkách Národního centra pro biotechnologické informace (NCBI) a také na mnoha dalších stránkách. BLAST dokáže rychle porovnat a porovnat dotazovanou sekvenci DNA s databází sekvencí, což z něj dělá kritický nástroj v probíhajícím genomickém výzkumu.
Co je technika BLAST?
Technika BLAST je metoda řešení stížností vyvinutá Albertem Barnetem . Mnemotechnická pomůcka znamená věřit, naslouchat, omlouvat se, uspokojovat a děkovat (tabulka 1). 6. Tento článek popisuje jeho užitečnost v péči o pacienty a jako nástroj klinické výuky.
Jak funguje BLAST DNA?
Jak BLAST funguje? BLAST identifikuje homologní sekvence pomocí heuristické metody, která zpočátku najde krátké shody mezi dvěma sekvencemi; metoda tedy nebere v úvahu celý sekvenční prostor. Po počáteční shodě se BLAST pokusí zahájit místní zarovnání z těchto počátečních shod.
Proč je BLAST rychlejší než Fasta?
Z hlediska složitosti běhu algoritmu je BLAST rychlejší než FASTA prohledáváním pouze významnějších vzorů vsekvence. Citlivost (nebo přesnost) BLAST a FASTA má tendenci být odlišná pro sekvence nukleových kyselin a proteinů (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
