Naproti tomu většina eukaryotických DNA ligáz spolu s archaálními a bakteriofágovými enzymy spadá do druhé podrodiny; tyto enzymy využívají ATP jako kofaktor.
Vyžadují ligázy ATP?
Obvykle se používají dvě DNA ligázy. … T4 ligáza vyžaduje ATP , zatímco ligáza E. coli vyžaduje NAD+ (nikotinamid adenindinukleotid je koenzym, který se skládá ze 2 nt spojených prostřednictvím jejich fosfátových skupin). Oba katalyzují spojení 5′-fosfátové a 3′-OH skupiny za vzniku fosfodiesterové vazby.
Proč ligázy potřebují ATP?
Dva kroky DNA ligační reakce
Samotná DNA ligační reakce má dva základní kroky. Za prvé konce DNA se musí náhodně srazit a zůstat pohromadě dost dlouho na to, aby se k nim ligáza spojila. … Aby mohl enzym provádět další reakce, musí být AMP v aktivním místě enzymu doplněn ATP.
Jaká je funkce ligáz?
DNA ligázy hrají zásadní roli při udržování genomové integrity tím, že spojují zlomy ve fosfodiesterové páteři DNA, ke kterým dochází během replikace a rekombinace, a v důsledku poškození DNA a jeho opravit. Tři lidské geny, LIG1, LIG3 a LIG4 kódují ATP-dependentní DNA ligázy.
Co jsou ligázy fungují aktivně nebo pasivně?
DNA ligáza je aktivní během replikace, procesu opravy a rekombinace DNA. Je široce používán při opravách jednovláknovýchzlomy v duplexní DNA živých organismů pomocí komplementárního vlákna dvojité šroubovice jako templátu, zatímco některé formy mohou specificky opravit poškození dvouvlákna.
