Peptidové vazby mají planární, trans, konfiguraci a podléhají velmi malou rotaci nebo kroucení kolem amidové vazby, která spojuje α-amino dusík jedné aminokyseliny s karbonylovým uhlíkem následujícího (obrázek 4-1).
Proč je rotace kolem peptidové vazby zakázána?
Proč je rotace kolem peptidové vazby zakázána a jaké jsou důsledky nedostatečné rotace? peptidová vazba má charakter částečné dvojné vazby, který zabraňuje rotaci. Tento nedostatek rotace omezuje konformace peptidové páteře a omezuje možné struktury.
Mohou se peptidové vazby ohýbat?
Vzhledem k tomu, že páteř polypeptidu, držená pohromadě peptidovými vazbami, je flexibilní (kvůli „rotaci kolem všech těchto vazeb“), řetězec se může ohýbat, kroutit, a ohýbat se do velmi široké škály trojrozměrných tvarů.
Jsou peptidové vazby reverzibilní?
Přestože tvorbu peptidové vazby lze zvrátit přidáním vody (hydrolýza), amidové vazby jsou velmi stabilní ve vodě při neutrálním pH a hydrolýza peptidových vazeb v buňkách je také enzymaticky řízen.
Mají peptidové vazby směrovost?
I když je geometrie peptidové skupiny pevná, vazby na obou stranách alfa uhlíků se mohou otáčet. To umožňuje flexibilitu v peptidové páteři. … Sekvence aminokyselin v proteinu má směrovost neboorientace, která je definována funkčními skupinami na koncích řetězce.
